Kynurenine通路库
专为发现新型代谢紊乱调节剂而设计
13 120种化合物
Kynurenine pathway（酪氨酸代谢通路）是一个代谢通路，通过降解色氨酸产生烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（NAD+。该通路的紊乱与多种疾病和障碍相关，包括传染病（如HIV）、神经系统疾病（阿尔茨海默病（AD）、亨廷顿病（HD）和肌萎缩性脊髓侧索硬化症（ALS））、情感障碍（精神分裂症、抑郁症和焦虑症）、自身免疫性疾病、周围疾病以及恶性肿瘤。我们工作的旨在寻找作用于酪氨酸代谢通路的新的潜在活性化合物，这些化合物可以作为早期药物开发的便捷且具有质量保证的起点。
典型格式
| 目录号 | 化合物数量 | 规格 | 储存形式 | 价格 |
| KYN-13-0-Y-10 | 13 120 41块板 |
试验即用型规格< 300 nL | 1536孔微孔板（Corning#4514） 前2列和后2列分别留空，每板320个化合物 |
立即询价 |
| KYN-13-10-Y-10 | 13 120 41块板 |
10µL@10mM DMSO溶液 |
384孔echo规格板（Labcyte#LP-0200） 前2列和后2列分别留空，每板320个化合物 |
立即询价 |
| KYN-13-50-X-10 | 13 120 164块板 |
50µL@10mM DMSO溶液 |
96孔板（Greiner#781270） 第1列和最后1列留空，每板80个化合物 |
立即询价 |
下载SD文件
- 库代码：KYN-13
- 版本：2023年3月17日
- 13 120种化合物
库的设计
针对以下目标，使用所有可用的蛋白质和配体结构数据搜索潜在活性物质：吲哚胺二氧化酶（IDO）、色氨酸二氧化酶（TDO）、3-羟基蒽酸二氧化酶（3-HAO）、酪氨酸氨基转移酶（KATs）、酪氨酸-3-单氧化酶（KMO）。
右图 1.酪氨酸在哺乳动物中降解色氨酸的途径。
筛选模型的制备和验证
从PDB中检索了所有可用的目标的3D结构。通过结构的交替对齐和比较显示，RMSD在0.4-0.71 Å2范围内，每个单独的蛋白质目标的序列的同一性>90%。考虑到配体结合参数（蛋白质-天然配体）和结合位点的几何参数，在所有代表性结构中只选择了一个结构用于模型制备。
右图2.IDO1的结合位点（2D0T（上）、4PK5（下）和用于分子对接的两个主要子口袋（蓝色和黄色））。
分子对接与药效团搜索
基于已知活性化合物和“蛋白质-天然配体”复合物，建立并验证了基于配体（IDO：3，TDO：4，KATs：3，KMO：2）和基于结构（IDO：3，TDO：6，3-HAO：2，KATs：3，KMO：4）的药效团模型。然后筛选了包含超过100万个化合物的类药性Enamine数据库。
上图 3.分子对接结果：天然配体（灰色）和命中配体（黄色）的叠加，具有基于结构的药效团特征。
分子示例
图 4.用于计算机筛选的基于配体的药效团模型。
分子对接计算和药效团搜索后的靶向库中化合物的数量：
对犬尿氨酸通路中涉及的蛋白质及其配体相互作用进行了仔细分析。使用所有可用的最先进的方法进行迭代计算搜索，以获得独特的潜在活性分子集。通过化学类型控制，用真正阳性结构基团和新的“无专利”结构核心来丰富化合物库。
已开发的靶向集旨在一步到位地实现发现任何特定靶标的高概率hit发现。
