异位 GPCR 库
专为发现新型异位配体而设计
14 400种化合物
尽管用正交选择性候选药物调节GPCR的成功案例不胜枚举,但在许多情况下,异位GPCR配体对这些生物靶点更为有效。小分子对GPCR的异位调控可以促使受体发生构象变化,这种变化通常不会产生明显效应,但在正位内源性配体存在的情况下,会对信号传到途径产生强烈影响。另一方面,由顽固刺激引发的GPCR可通过异位调控进行调节,从而为这些目前尚无法攻克的靶点开辟了新的机遇。两种已应用于临床的GPCR异位调节剂(Cinacalcet和Maraviroc)充分证明了这一领域的研究前景。与大多数正位配体相比,这些配体的另一个优点是分子量相对较低,因此口服生物利用度更高。此外,与靶向保守结合位点的药物相比,异位位点通常不太保守,能够开发具有更高亚型选择性的活性物质。
Enamine的异位GPCR化合物库是异位GPCR调节剂药物发现领域的有用起点。
典型格式
目录号 | 化合物数量 | 规格 | 储存形式 | 价格 |
AGR-14-Y-0 | 14 400 157块板 |
适用于一次实验的 任意规格 |
384孔微孔板 前2列和后2列分别留空,每板320个化合物 |
立即询价 |
AGR-14-Z-5 | 14 400 40块板 |
5µL@10mM DMSO溶液 |
1536孔微孔板,Echo认证 前4列和后4列分别留空,每板 1280 个化合物 |
立即询价 |
AGR-14-Y-50 | 14 400 157块板 |
50µL@10mM DMSO溶液 |
384孔微孔板 前2列和后2列分别留空,每板320个化合物 |
立即询价 |
AGR-14 | 14 400 | 客户定制 | 任意定制形式 | 立即询价 |
库的设计
在化合物库的设计中使用了基于配体和基于结构的方法。基于配体的方法依赖于使用具有高活性值的已知配体的参考集进行三维药效团搜索(来自ChEMBL和BindingDB的200多个化合物)。主要关注于已在药物发现中得到确认的B 类GPCR 的异位调节剂。使用参考化合物集创建了两个药效团模型,并使用活性和非活性配体的训练集进行验证(图1)。最终,从Enamine MedChem集(71 万个小分子)中筛选出6,200个小分子,将其纳入基于药效团的异位GPCR子集。
图1.参考活性化合物(绿色)和库中的hit化合物(灰色)的药效团叠加。
基于结构的方法应用于人类胰高血糖素受体(GCGR)和人类促肾上腺皮质激素释放因子1受体(CRF1R)。对5EE7和4K5Y PDB条目中记录的相应蛋白质结构进行了优化,并使用Glide(Schrödinger软件)进行对接计算。与共晶配体相比,至少有50%的评分效力的化合物被选为命中物,并包含在目标集中:h-GCGR集合——200个化合物;h-CRF1R集合:7,200个化合物(图2和图3)。
图2.从对接和人类胰高血糖素受体共结晶配体(绿色)获得的一个hit(红色)的结合模式。
图3.将CRF1R异位位点与Enamine MedChem筛选化合物(绿色)和共结晶配体CP-376395(橙色)对接后获得的命中化合物叠加。