微管蛋白库
潜在微管蛋白配体库
3 200种化合物
微管蛋白靶向库采用不同方法的组合设计，包括分子对接、子结构和相似性、拓扑类似物搜索、分子参数限制和专门开发的结构过滤器。
微管蛋白库以预装板格式提供，也可按客户定制的格式快速提供。
典型格式
| 目录号 | 化合物数量 | 规格 | 储存形式 | 价格 |
| TBL-3200-0-Y-10 | 3 200 10块板 |
随时检测格式＜300nL | 384孔板 前2列和后2列分别留空，每板320个化合物 |
立即询价 |
| TBL-3200-10-Y-10 | 3 200 10块板 |
10µL@10mM DMSO溶液 |
384孔板 前2列和后2列分别留空，每板320个化合物 |
立即询价 |
| TBL-3200-50-Y-10 | 3 200 10块板 |
50µL@10mM DMSO溶液 |
384孔板 前2列和后2列分别留空，每板320个化合物 |
立即询价 |
库的设计
考虑和分析了最近在PDB中记录的最适合进行计算机筛选的蛋白质结构：4YJ2、5C8Y、5CA1。这三种微管蛋白结构的结合位点中蛋白质-配体相互作用的主要特征非常相似，并且可以叠加。因此，基于结合口袋中关键氨基酸残基的特征和在分析蛋白质结构中观察到的配体相互作用，构建了蛋白质对接模型。
对接模型已使用一组已知活性（110个配体）和非活性分子的参考集进行了验证。根据参考化合物集的活性数据进行了计算约束的修正。
图 1.对接计算后命中结合确认示例
图 2.对接得分高命中化合物Z666232790的2D配体相互作用图
2D相似性搜索和拓扑类似物搜索
- 参考化合物集是从现有文献来源和数据库中精心编制的：ChEMBL、BindingDB和PudChem。
- 使用Tanimoto相似度范围95-80%进行化合物筛选。
- 使用拓扑场和生物电子等排基团替换来寻找最有效的微管蛋白抑制剂的类似物。
活性分子示例
使用这种方法选择了大约900种化合物。
微管蛋白库中分子示例
应用于该化合物库的过滤器
- 应用了内部开发的药物化学过滤器，用于对Enamine库存化合物集进行预选。
- 包括PAINS、Eli Lilly、REOS和常见功能性基团过滤器。
- 完全符合五规则（Rule of Five）。
