RNA库
能与 RNA 结合的化合物库
15 520种化合物
最近RNA生物学的实质性进展强调了RNA在正常和异常细胞功能中的重要性。RNA对转录调控、翻译调控、蛋白质功能和催化至关重要，这些功能通常由蛋白质承担。它还强调了靶向RNA治疗多种疾病的潜力，包括细菌、病毒感染和癌症。
我们结合了不同的计算机方法，设计了一个专注于RNA为靶点的最佳化合物库。该化合物库已进行了预装处理，以便快捷地获取。使用我们的RNA靶向库，您将获得多重益处，节省hit扩增和优化上的时间和成本：
- 从超过400万种化合物的干粉库存中重新供应类似物和hit样本
- 通过我们的REAL数据库技术对后续库进行简单、低成本的合成
- 及时提供“命中到先导”项目支持，并提供广泛的现场能力。
典型格式
| 目录号 | 化合物数量 | 规格 | 储存形式 | 价格 |
| RNA-15520-0-Z-2 | 15 520 13块板 |
≤300nL@2mM DMSO溶液 |
1536孔微孔板（Labcyte#LP-0400） 第1-4和44-48列留空，每板1280个化合物 |
立即询价 |
| RNA-15520-10-Y-10 | 15 520 49块板 |
10µL@10mM DMSO溶液 |
384孔微孔板（Greiner#781280） 前2列和后2列分别留空，每板320个化合物 |
立即询价 |
| RNA-15520-50-X-10 | 15 520 194块板 |
50µL@10mM DMSO溶液 |
96孔板（Greiner#650201）圆（U）底 第1列和第12列分别留空，每板80个化合物 |
立即询价 |
| RNA-15520 | 15 520 | 客户定制 | 任意定制形式 | 立即询价 |
库的设计
RNA可以形成明确的二级结构，例如双螺旋、发夹、膨胀、内环和茎，为设计治疗药物提供了结构基础。我们在设计RNA靶向库时考虑到了这些结构特征。我们专注于与RNA结合并与不同类型的二级结构形成相互作用的化合物。
从公共来源/数据库（ChEMBL、PubChem、Drugs.com 等）收集活性化合物的参考集，然后过滤以去除非选择性结合物和具有反应性基团的化合物。对MedChem过滤的Enamine库存集合的320万种化合物进行相似性搜索（化学指纹图谱），得到了2,800个分子的子集，相似性至少为90%。
使用药效团搜索和形状相似性搜索以新的结构来丰富该化合物库，这些结构可以形成与已知配体相同类型的相互作用。根据大多数已知结合分子的结构，使用了三种3D药效团模型进行计算机筛选。此外，还应用亚结构搜索来寻找已知对与RNA相互作用很重要的，具有常见结构基团和核心的分子（Inforna数据库用于亚结构选择）。
分子建模和对接
此外，我们分析了PDB RNA配体复合物中记录的所有内容。选择四种代表最常见的RNA-配体相互作用类型，已被选择用于分子对接和查询生成——1lvj、1q8n、4lvy、6fz0 pdb项。所有查询模型都使用一小组已知的活性和非活性配体进行验证，并随后对其进行了修正。
分子对接结果的例子（6fz0），天然配体为灰色，对接命中化合物（Z1723434664）为黄色。
使用1qn8 pdb项的分子对接示例，对接配体，鉴定为黄色的命中化合物（Z1135145616）。
该化合物库仅包含类药化合物，为转录后基因调控研究、抗病毒和抗菌药物发现项目提供良好的基础。
