蛋白质拟态化合物库

能够模拟常见蛋白质结构的精选分子

8 960种化合物

在人体蛋白质组中发现了250,000多种单独的蛋白质-蛋白质相互作用（PPIs）。尽管许多表现出复杂的拓扑结构和庞大的表面区域，但在许多情况下，成功的结合是通过有限数量的关键残基（“热点”）实现的。多篇文献报道了开发小分子调节蛋白质相互作用（PPIs）的计算和多样性导向的方法。其中，非肽类a-螺旋和β-折叠模拟物尤为重要，因为它们在导致癌症、神经退行性疾病、炎症和免疫疾病等多种失调通路中起关键作用。

典型格式

目录号	化合物数量	规格	储存形式	价格
PML-8960-Y-0	8 960 28块板	≤300nL@2mM DMSO溶液	384孔微孔板（Greiner#782401) 第1、2和23、24列留空，每板320个化合物	立即询价
PML-8960-Y-10	8 960 28块板	10µL@10mM DMSO储备溶液	96孔微孔板，Echo认证前2列和后2列留空，每板320个化合物	立即询价
PML-8960-X-50	8 960 112块板	50µL@10mM DMSO溶液	96孔微孔板第1列和最后1列留空，每板80个化合物	立即询价
PML-8960	8 960	客户定制	任意定制形式	立即询价

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库代码：PML-8960
版本：2023年9月29日
8 960种化合物
PPI-40子库

库的设计

传统的三残基方法

α-螺旋模拟物

β-折叠模拟物

基于配体的方法

基于靶向的方法。我们设计了针对选定的a-螺旋结构域和a-螺旋和β-折叠的聚焦化合物集，如mdm2-p53、mdm2-CK1α、HIF1-α、MEF2-HDAC4、HIV-1 gp41、CD81/CV、Bcl-2/Bcl-xL等。通过虚拟筛选进行选择后，将偏好设置为具有新化学型的结构。

“传统”三残基方法包括具有不寻常核心化合物的设计，这些核心带有常规的关键残基，可模拟位于一个识别面（“热点”）上的i, i+3/i+4和i+7残基。在对a-螺旋界面进行建模时，我们还考虑了双面螺旋模拟物。对于β-折叠模拟物，我们应用了三种具有不同类型相互作用的查询模型：π-π堆叠、阳离子-π和氢键相互作用以及S-π相互作用：后者重点设计的实例是对Bim BH3结构域与Mcl-1和Bcl-2之间相互作用的建模，并鉴定具有高Fsp³特性的融合多氢化合的氮杂环。

基于配体的方法。选择了拓扑结构接近已知a-螺旋和β-折叠模拟物的新化学型。基于形状的相似性和药效团筛选被用作化合物库设计的主要工具。

我们特别选择了独特的富含Fsp³的骨架，其中包含阶梯状的环状骨架，以增强与目标a-螺旋和β-折叠基序的拓扑和药效团相互作用。