PPI 片段库

能够模拟蛋白质结构基序和热点残基的片段

3 600种化合物

蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)调节着生命周期的大多数方面,是当代药物开发中最具吸引力和前景的靶点。这一领域仍然没有得到很好的探索,对于参与这种相互作用的蛋白质没有共同的规律。使用传统的高通量筛选方法和算法无法经济高效地处理这种复杂的生物系统。然而,基于片段的方法在寻找新型 PPI 抑制剂方面取得了丰硕成果。我们创建了新的PPI 片段库,采用了了专门的设计,其中包括对常见 PPI 抑制剂的系统性知识和特殊结构分子的选择。

使用我们的 PPI 片段进行命中查找,您可以获得多种好处,从而节省先导化合物生成的时间和成本。库中的每个片段都可以很容易地用现有的库存类似物或通过我们的 REAL 数据库技术合成新的衍生物进行跟踪。

典型格式

目录号 化合物数量 规格 储存形式 价格
PPIF-3600-Y-10 3 600
12块板
10µL@10mM
DMSO储备溶液
384孔微孔板(Labcyte#LP-0200)Echo认证 立即询价
PPIF-3600-X-50 3 600
45块板
50µL@10mM
DMSO储备溶液
96孔板(Greiner)
第1列和最后1列留空,每板80个化合物
立即询价
PPIF-3600-X-100 3 600
45块板
100µL@10mM
DMSO储备溶液
96孔微孔板
第1列和最后1列留空,每板80个化合物
立即询价
PPIF-3600 3 600 客户定制 任意定制形式 立即询价

下载SD文件

  • 库代码:PPIF-3600
  • 版本:2020年5月24日
  • 3 600种化合物
  • 储存在100mM的DMSO溶液中
  • 库代码:PPIF-3200
  • 版本:2021年9月16日
  • 3 200种化合物
  • 储存在40mM的DMSO-D6溶液中
  • PPIF-3600子库

主要特征

最近在 PPI 片段领域的研究表明,由于接触表面积较大,与普通片段相比,需要更高的分子量。因此,使用" 四原则 "限制来提取初始 PPI 片段子集,因为它们通常更大且亲脂性更强。此外,我们还使用具有多个经过验证的描述符和基于机器学习的方法(决策树)来完善片段库。

应用了“热点”概念,即使用PPI中涉及的“关键”氨基酸残基。大量选定的片段包含与这些热点相匹配的基团/部分结构。此外,库中富含具有α螺旋状结构的分子,能够模拟蛋白质基序。另外,由于氢键通常在 PPI 中起着至关重要的作用,因此优先选择携带至少一个氢键供体(>70%)和一个氢键受体(100%)的分子。

分子示例

分子特性

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