卤素富集片段库

最多样化的卤素富集片段

1 920 种化合物

卤素富集片段库(HEF)的概念在药物化学领域已获得广泛关注,并得到了多次成功筛选活动的支持。[1,2] 这类库的设计旨在探索由卤素介导的相互作用,这些相互作用在分子识别和结合亲和力中可发挥关键作用。HEF所利用的关键相互作用——卤键(halogen bonding),自最初通过X射线晶体学发现以来已被广泛研究。[3] 其静电本质如今已得到充分理解,并被证明能显著影响药物-靶标相互作用的选择性和有效性。[4,5,6]


通过σ-空穴相互作用形成的卤键

卤素键合的一个关键因素是σ-空穴,其特性可以通过改变(杂)芳香环体系及其取代模式来进行“调节”。这种可调控性使得能够精确控制相互作用的强度和方向性。

作为杂环化学领域的全球领导者,Enamine已合成了数千种新型卤代骨架,打造了目前可获得的最多样化的卤代核心杂环化合物集合。我们精心设计的卤素富集片段库包含了最相关的片段,可用于探索通过这些非共价卤素介导相互作用产生的结合亲和力。

典型格式

目录号 化合物数量 规格 储存形式 价格
HEF-1920-10-Y-100 1 920
6块板
10µL@100mM
DMSO现货溶液
384孔微孔板,Echo qualified Labcyte
每板320个化合物
立即询价
HEF-1920-25-X-100 1 920
24块板
25µL@100mM
DMSO现货溶液
96孔板,Greiner Cat. No 650201,圆底(U型底)
第1列和第12列分留空,每板80个化合物
立即询价
HEF-1920-50-X-100 1920
24块板
50μL@100mM
DMSO现货溶液
96孔板,Greiner Cat. No 650201,圆底(U型底)
第1列和第12列分留空,每板80个化合物
立即询价

下载SD文件

  • 库代码:HEF-1920
  • 1 920 种化合物

主要特征

  • 用于探测卤素键的多样化(杂)芳香片段集合
  • 所有化合物均包含至少一个非氟卤素原子
  • 不含PAINS结构,仅含药物化学友好的化合物
  • 可从库存及Enamine REAL库进行快速后续跟进

HEF库中的化合物示例

库的设计

该片段库从一个超过25万种化合物的精选数据库中构建而成,所有化合物均严格符合“三规则”(Ro3),并经过药物化学标准筛选。每个化合物至少包含一个重卤素原子(Cl、Br或I),其中95%的化合物仅含有一个重卤素原子。卤素分布如下:183个碘化物(9.5%)、963个溴化物(50.1%)、684个氯化物(35.6%)。其余4.8%为二氯代衍生物。此外,库中还包含194个含氟化合物(10.1%)。所选片段的重原子数(HA)范围为6至19,其中大多数(1,206个片段)集中在12–16个重原子之间。每个片段包含一至三个环,其中97%含有一个或两个环。我们还纳入了Frank M. Boeckler最初提出的HEFLib中的200个片段中的154个。骨架分析揭示了最常出现的(杂)芳香环体系。


HEF库中最常用的杂芳香环体系

分子特性

精选出版物

1. Embracing the Diversity of Halogen Bonding Motifs in Fragment-Based Drug Discovery—Construction of a Diversity-Optimized Halogen-Enriched Fragment Library.
J. Heidrich, L. E. Sperl, F. M. Boeckler Front. Chem. 2019, 7. DOI: 10.3389/fchem.2019.00009

2. Halogen interactions in protein-ligand complexes: implications of halogen bonding for rational drug design.
S. Sirimulla, J. B. Bailey, R. Vegesna, M. Narayan J. Chem. Inf. Model. 2013, 53, 2781–2791. DOI: 10.1021/ci400257k

3. Ultrahigh resolution drug design I: Details of interactions in human aldose reductase-inhibitor complex at 0.66 Å.
E. I. Howard, R. Sanishvili, R. E. Cachau, A. Mitschler, B. Chevrier, P. Barth, V. Lamour, M. Van Zandt, E. Sibley, C. Bon, D. Moras, T. R. Schneider, A. Joachimiak, A. Podjarny Proteins Struct. Funct. Genet. 2004, 55, 792–804. DOI: 10.1002/prot.20015

4. Halogen bonding: an electrostatically-driven highly directional noncovalent interaction.
P. Politzer, J. S. Murray, T. Clark Phys. Chem. Chem. Phys. 2010, 12, 7748–7757. DOI: 10.1039/C004189K

5. Halogen bonding: the sigma-hole.
T. Clark, M. Hennemann, J. S. Murray, P. Politzer J. Mol. Model. 2007, 13, 291–296. DOI: 10.1007/s00894-006-0130-2

6. Halogen-Enriched Fragment Libraries as Leads for Drug Rescue of Mutant p53.
R. Wilcken, X. Liu, M. O. Zimmermann, T. J. Rutherford, A. R. Fersht, A. C. Joerger, F. M. Boeckler J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 6810–6818. DOI: 10.1021/ja301056a

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