表观遗传学库
聚焦靶向多个表观遗传靶点的化合物库
38 080种化合物
近年来，在表观遗传学领域的发现为除了DNA序列之外的遗传信息如何调节生物体功能提供了坚实的分子基础。Enamine公司很自豪能为我们的客户提供专注于几类表观遗传靶点的化合物库：组蛋白去乙酰化酶（HDACs）、组蛋白甲基转移酶（HMT）、DNA甲基转移酶（DNMT）、溴结构域。
库的设计
由于表观遗传靶标类别的差异非常大，因此使用了不同的方法创建化合物库。每一类表观遗传靶点都代表不同家族，应分别对待。在创建化合物库时，我们的主要思想是创建针对特定家族的化合物库，而不是针对特定的分子靶点。这种方法基于根据其结合位点的信息（包括位点的空间结构、氨基酸组成等）将来自相似家族的分子靶点划分为多个聚类，从而使我们能够构建描述靶点家族及其与配体的相互作用特异性的配置文件。这些数据为选择最具代表性的质心蛋白结构提供了坚实的基础，并允许构建初步的药效团模型，以过滤掉那些结构特征不足以显示良好结合的化合物。下一步包括进一步减少需要进行对接过程的化合物数量的先进三维药效团模型创建。接下来进行分子对接，对所得的结果进行最终调整和可视化检查。
为了创建每个靶点类别的库，采用了结合了基于配体和基于受体的方法的综合方法。因此，通用流程图可以表示如右图：
- 分析所有可用的结构数据（PDB，文献资源等）
- 药效团模型的创建和验证
- 使用相互作用关键点、限定体积和空间构象要求进行高级药效团搜索
- 分子对接
- 对获得的结果进行精确调整和可视化检查
这种方法使我们能够创建作为早期研究未充分探索靶点宝贵工具的化合物库，从而有机会发现对目标具有高亲和力的化合物。因此，为进一步的命中探索步骤提供坚实的基础，研究人员可以在这一步骤中专注于增加命中化合物对目标家族其他代表的特异性。因此，通用流程图可以表示如右：
配体-受体相互作用的HDACs模式。
