羧酸生物电子等排体片段库

药物化学中最可靠的羧酸替代来源之一

1 280 种化合物

与伦敦癌症研究所（The Institute of Cancer Research, London）合作，我们开发了一个强大的基于片段的药物发现（FBDD）工具，用于搜索羧酸生物电子等排体（CAB）片段命中。这种方法为传统药物优化过程中羧酸基团的替换提供了一种替代方案。虽然-COOH 基团存在于多种获批药物中，并且对靶标结合有显著贡献，但羧酸可能会限制细胞渗透性并带来毒性风险。尽管已经报道了许多羧酸生物电子等排体，但任何生物电子等排替换的结果无法轻易预测。这个 CAB 片段库提供了一个筛选工具包，可以在药物发现的早期阶段识别羧酸的替代物，找到与目标靶标形成关键结合相互作用的命中化合物，这些命中化合物可能转化为更大的先导分子。

典型格式

目录号	化合物数量	规格	储存形式	价格
CAB-1280-10-Y-100	1280 4块板	10μL@100mM DMSO溶液	384孔板（Greiner#781280）前2列和后2列分别留空，每板320个化合物	立即询价
CAB-1280-25-Y-100	1280 4块板	25μL@100mM DMSO溶液	384孔板（Greiner#781280）前2列和后2列分别留空，每板320个化合物	立即询价
CAB-1280	1280	客户定制	任意定制形式	立即询价

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库代码：CAB-1280
版本：2024年11月11日
1 280 种化合物
DMSO 溶液中浓度为 100mM

主要特征

涵盖所有可靠的 CAB 替代物，预测的 pKa 范围为 1 至 14。
实验验证的溶解度：在PBS缓冲液中的溶解度为1 mM，在DMSO中的溶解度为100 mM。
库中每种生物电子等排类型内的化合物具有高多样性。
库中不包含反应性或不稳定的化合物，且不含PAINS（泛活性化合物）。
可以从库存和 REAL Space 中快速生成新的衍生物，提高药物发现的效率。

库中的分子示例

库的设计

通过对现有文献的分析结合 ICR（癌症研究所）的内部经验，我们选择了超过三十种 CAB（羧酸生物电子等排体）亚结构类型。我们在库存中鉴定了超过 40 000 种含有 CAB 基团的化合物。识别出了一些代表性不足的类别，并合成了新的化合物以填补这些空白。含有羧酸基团或高反应性基团的化合物被筛选出去。采用了一种略微放宽的“三规则”(Ro3)版本，同时进行了多样性选择，以符合基于片段的文库设计的标准实践，同时允许一定的灵活性以增强文库的大小和多样性。进一步扩展了选择范围，包括那些性质与在片段筛选中表现最佳的功能多样的片段相一致的化合物（Deane等人，《药物化学杂志》2022, 65, 11404−11413）。最终的选择仅包含通过了基于浊度测定的溶解度阈值研究的化合物（DMSO 中的溶解度为 100mM，PBS 中 pH 7.4 时的溶解度为 1mM）。文库组成由 Enamine 和 ICR 专家进行了视觉检查，以去除简单和不利于药物化学的化合物。CAB 类别的分布考虑了药物化学吸引力和合成可行性，后者对于命中后续阶段至关重要。四唑和 N-酰基磺酰胺是文库中最丰富的类别，其次是 1,2,4-噁二唑、3-磺酰基-1,2,4-三唑、羟基酸、氧杂环丁烷-3-醇、3-羟基吡唑和其它总共 20 种 CAB 类别。