抗结核化合物库

专为发现新型、高效且安全的治疗方法而设计

2 500 种化合物

结核病（TB）是全球最具威胁性的疾病之一，有可能引发下一次全球大流行。由于其传播方式和高死亡率，结核病已成为最猖獗的传染病之一。缺乏有效的治疗方法以及耐药性的迅速出现，使其成为全球公共卫生领域最紧迫的挑战之一。结核分枝杆菌（Mtb）持续发生变异，使其成为最危险且最难治疗的细菌性疾病之一。早期诊断困难以及耐药菌株的普遍存在，导致结核病极难被及时发现和治疗。因此，抗结核药物的研发至关重要，是预防未来大流行的优先事项。这需要进一步加大科学研究投入，并通过合理的药物设计来应对该疾病导致的高死亡率。

该化合物库以预装板形式提供，可快速投入使用，并为苗头化合物的后续研究提供多项支持：

  • 苗头化合物及类似物补货： 可从超过440万种化合物的干粉库存中快速补充苗头化合物及其类似物，并立即进行质量控制（QC）检查。
  • 药物化学（MedChem）支持： 在苗头化合物的后续验证和优化至先导化合物系列的过程中，提供专业的药物化学支持。
  • 当日ADME检测： 提供当日完成的ADME（吸收、分布、代谢、排泄）测试，以帮助优先进行分子设计和合成。

典型格式

目录号 化合物数量 格式 储存形式 价格
ATB-2500-10-Y-10 2 500
14块板		 10µL@10mM
DMSO溶液		 384孔板，Greiner #781280
前2列和后2列分别留空，每板320个化合物		 立即询价
ATB-2500-50-X-10 2 500
53块板		 50µL@10mM
DMSO溶液		 96孔板，Greiner #650160
第1列和第12列分别留空，每板80个化合物		 立即询价
化合物库 & 后续跟进包： ATB-2500-10-Y-10 化合物库，提供从干粉库存和新鲜DMSO溶液中补货的苗头化合物，并额外提供240多种来自库存的类似物，以及从REAL Space进行后续合成的类似物

立即询价

* 我们很乐意以最方便您项目的格式提供我们的化合物库。请在以下我们标准的微孔板中进行选择：Greiner Bio-One 781270、784201、781280、651201 或 Echo Qualified 001-12782 (LP-0200)、001-14555 (PP-0200)、001-6969 (LP-0400)、C52621，或者您可以提供您偏好的实验器具。如需化合物混合池，我们也可以根据要求提供。

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抗结核化合物库下载
  • 版本：2025年3月7日
  • 2 500 种化合物
莽草酸激酶亚库下载
  • 版本：2025年3月7日
  • 240 种化合物

库的设计

在设计该化合物库并筛选最具前景的分子时，我们重点关注了结核分枝杆菌（Mtb）细胞壁的复杂性以及化合物穿透细胞膜所面临的困难。尽管没有采用某些通用的、固定的规则性过滤标准，但我们仍基于已发表的文献数据，以及对具有细胞活性与无细胞活性化合物的结构特征分析，尽可能剔除了所有可能在膜穿透性方面存在问题的分子。

在深入研究了结核分枝杆菌（Mtb）所特有的生物化学通路及形态学特性后，我们筛选并优先确定了一组蛋白质靶点，用于进行计算机虚拟筛选（vHTS），以挑选出具有潜在活性的化合物。总体而言，该化合物库所针对的蛋白靶点可分为两大类：与细胞壁合成相关的蛋白，以及在真核生物中不存在的、Mtb特有的必需蛋白靶点。

丙氨酸消旋酶 (Alanine racemase, Alr): 催化L-丙氨酸和D-丙氨酸之间的相互转化，D-丙氨酸是肽聚糖交联的关键组分。

dTDP-4-脱水鼠李糖 3,5-差向异构酶 (dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase, RmlC): 参与dTDP-L-鼠李糖的生物合成，该物质是连接阿拉伯半乳聚糖的半乳糖区域与肽聚糖分子所必需的。

烯酰基-[酰基载体蛋白]还原酶 [NADH] (Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH], InhA): 参与分枝菌酸的生物合成，在脂肪酸延长过程中起关键作用。

十一异戊二烯基磷酸-β-D-核糖氧化酶 (Decaprenylphosphoryl-beta-D-ribose oxidase, Dpre1): 是催化生成十一异戊二烯基磷酸阿拉伯糖（DPA）的复合物的组成部分，DPA是细胞壁阿拉伯聚糖合成的关键前体。

N-乙酰葡糖胺-1-磷酸尿苷转移酶 (N-Acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase, GlmU): 催化UDP-GlcNAc生物合成的最后两步反应，对脂多糖（LPS）脂质A的合成至关重要。

莽草酸激酶 (Shikimate kinase, AroK): 利用ATP磷酸化莽草酸的3-羟基，是芳香族氨基酸和次级代谢物共同前体合成所必需的。氨基酸的生物合成是极具吸引力的药物设计方向，因其包含一系列丰富的酶家族。

β-内酰胺酶 (Beta-lactamase): 负责细菌对β-内酰胺类抗生素（如青霉素）产生耐药性。

异柠檬酸裂合酶 (Isocitrate lyase): 催化乙醛酸分流（glyoxylate shunt）的第一步反应，即从C2化合物合成C4二羧酸。

ATP酶 (ATPases, ClpC, ClpX): 作为伴侣蛋白，通过细菌蛋白酶体诱导蛋白质降解，在细菌蛋白质稳态中发挥关键作用。

Mtb调控性丝氨酸蛋白酶 (Mtb regulatory Serine Proteases, ClpP1P2): 形成细菌蛋白酶体的丝氨酸蛋白酶，负责细菌内的蛋白质稳态和降解。

肽基tRNA水解酶 (Peptidyl tRNA hydrolase, Pth): 一种Mtb特有的必需RNA水解酶，参与细菌稳态和蛋白质合成的调控。

本次虚拟高通量筛选（vHTS）流程包括：采用基于网格的方法表示结合位点，并根据文献数据（如突变实验）或配体-蛋白相互作用图谱设定约束条件，随后进行部分或完全匹配。除了依据经验性分子对接评分对化合物进行排序外，我们还对结果构象进行了人工视觉检查，以评估其结合模式的可靠性。然而，需要指出的是，针对所选靶点的参考化合物数量相对较少，且每个基于靶点的参考化合物集合内部的多样性程度较低。

化合物 Z1603549506 在莽草酸激酶（Shikimate Kinase）结合位点中的结合模式示例。

化合物 Z1313265676 与 RmlC 还原酶结合的预测构象，以蛋白质的带状图（ribbon）和形状表面（shape）表示。

化合物 Z111780734（左）和 Z189105794 在 InhA 酶活性位点的预测结合构象示例。

参考文献

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23. Identification of cell wall synthesis inhibitors active against Mycobacterium tuberculosis by competitive activity-based protein profiling
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