REAL 空间
数十亿种按需合成(make-on-demand)的分子
REAL 包含了 649 亿种按需合成的分子,是目前市场上最大的可商业获取化合物库。这些化合物通过超过 167 种经过充分验证的平行合成方案,应用于超过 170,202 种合格的试剂和分子砌块来组装而成。合成方案包括标准和高级的一锅法程序。这些方案在步骤数量、纯化类型和化合物处理方面有所不同,因此在交付产品所需的工作量方面也有所不同。
REAL 空间并不是一个传统意义上的枚举数据库:所有搜索结果都是在查询时实时生成的,只要它们具有与查询相同的特征。目前,REAL 空间可以通过 InfiniSee 访问。InfiniSee 是由 Enamine 和 BioSolveIT 联合开发的一款化学信息学软件。InfiniSee 的丰富资源允许高效的命中探索,从发现以前未知的类似物到骨架跳跃(scaffold hopping)。该工具不使用 Tanimoto 相似性度量,而是采用药效团风格的特征,这些特征不严格依赖于子结构模式,而更多地与化合物的性质相关。因此,该工具能够避免现有库存筛选集合中的可用性偏差,向知识产权自由区域扩展。
令人惊讶的是,REAL 空间包含了 649 亿种化合物的化学空间,却只需要几百兆字节(MB)的存储空间,并且在标准计算机上的平均搜索时间仅需 2 到 4 分钟。
通过 InfiniSee 访问 REAL 空间的一些关键事实如下:
- 生成的化合物是虚拟的,但它们是基于 Enamine 现有的分子砌块和合成方案,可以实际合成。--即时可得
- 合成时间为 3 到 4 周,平均成功率达到 80% 以上
- 649 亿分子:这是世界上最大的、超快速可搜索的化学空间
- 对典型先导化合物的搜索时间平均为 2 到 4 分钟
- 卓越的骨架跳跃能力,可以帮助研究人员探索知识产权自由的区域