Enamine REAL Space

数十亿种按需合成的化合物

REAL Space 包含 781 亿个按需合成分子,是目前市场上可提供的最大规模的合成可及化合物库。REAL Space 中的化合物是通过 172 种经过充分验证的平行合成方案,应用于 181,288 种库存合格的试剂和砌块组装而成的。这些合成方案包括标准和高级的一锅法操作。它们在反应步骤数、纯化方式以及化合物处理流程上各不相同,因此所需的交付工作量也有所不同。

Enamine REAL Space 正在不断演进,为研究人员提供更多选择,从而推动他们的项目向前发展。

REAL Space 既可以通过枚举数据集的形式访问,也可以作为基于合成子的空间进行访问。后者在一般意义上并不是一个枚举数据库:所有的搜索结果都是实时生成的,只要它们具备与查询条件相同的特征。目前,基于合成子的 REAL Space 可以通过 InfiniSee 软件,或者通过合成子及其组合规则来访问。

InfiniSee 是一款与德国 BioSolveIT 公司联合开发的化学信息学软件。InfiniSee 庞大的资源库使得苗头化合物探索变得高效:从寻找前所未有的类似物到骨架跃迁。该工具不采用 Tanimoto 相似性度量,而是使用药效团风格的特征,这些特征不局限于固定的子结构模式,而与分子性质更为相关。因此,该工具能够帮助研究人员摆脱现有库存筛选库的“可用性偏差”,转向无知识产权限制的领域。令人惊叹的是,781 亿个化合物的化学空间仅存储在一个几百兆的压缩文档中,而在标准计算机上的平均搜索时间仅为 2 到 4 分钟。

关于通过 InfiniSee 访问 Enamine REAL Space 的一些事实:

  • 生成的化合物虽然是虚拟的,但它们属于 REAL 库——即“即时可及”的实体分子
  • 合成周期为 3-4 周,平均成功率超过 80%
  • 781 亿个分子:这是世界上规模最大、可超快搜索的化学空间
  • 针对典型的先导化合物,平均搜索时间仅为 2 到 4 分钟
  • 具备卓越的骨架跃迁能力,可探索无知识产权限制的区域

获取方式

Enamine REAL Space 可通过以下平台获取:

Pharos-3D(提供 3D 空间搜索及基于药效团的模型,适用于苗头化合物扩展、骨架跃迁和先导化合物优化)

Hyperspace(提供 2D 药效团描述符;支持子结构及相似性搜索)

exaScreen(提供 3D 搜索功能)

您也可以通过 BioSolveIT 的以下软件访问:

FTrees(模糊药效团搜索)

SpaceLight(指纹/Tanimoto 相似性搜索)

SpaceMACS(子结构匹配)

点击此处获取更多信息。

您可以在此处下载并试用 InfiniSee。

帮助

InfiniSee 使用起来非常简单。不过,以防万一,这里还是为您提供了一些帮助指引

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