Enamine REAL 空间
数十亿种按需合成的化合物
REAL 化合物空间包含 769 亿种 可按需合成的化合物,是目前最大规模的可合成化合物供应资源。REAL 空间中的化合物是通过 172 种经过验证的平行合成路线,对 181 288 种库存合格的试剂和分子砌块进行组合而生成的。这些合成路线包括标准和先进的“一锅法”合成步骤。它们在步骤数量、纯化方式以及化合物处理方式上有所不同,因此在交付产品时所需的工作量也不同。
Enamine REAL 化合物空间在不断发展,为研究人员提供越来越多的选择,助力推动他们的项目进展。

REAL 化合物空间既可以作为枚举数据集使用,也可以作为基于合成子(synthon)的空间使用。后者在一般意义上并不是一个枚举数据库:所有搜索结果都是根据与查询条件相同的特征实时生成的。目前,基于合成子的 REAL 空间可通过 InfiniSee 或通过定义合成子及其组合规则来访问。
InfiniSee 是由 Enamine 与 BioSolveIT 联合开发的化学信息学软件。InfiniSee 拥有庞大的资源库,可实现高效的苗头化合物(hit)探索:从发现此前未知的类似物,到进行骨架跃迁(scaffold hopping)。该工具不使用传统的 Tanimoto 相似性度量方法,而是采用基于药效团(pharmacophore-style)的特征进行匹配。这些特征并不严格依赖于特定的子结构模式,而是更贴近分子的性质。因此,InfiniSee 能够帮助研究人员跳出传统库存化合物筛选集合的局限,探索更具创新性的、无知识产权障碍(IP-free)的化学空间。令人惊叹的是,这个包含 769 亿个化合物 的化学空间,仅以几百兆字节(MB)的压缩文件形式存储。在普通计算机上进行一次搜索的平均耗时仅为 2 到 4 分钟。
通过 InfiniSee 访问 Enamine REAL 化合物空间的几个关键事实:
- 生成的化合物虽然是虚拟化合物,但它们是 REAL 化合物--即可快速合成获得的化合物
- 合成周期为 3-4 周,平均合成成功率超过 80%
- 769 亿个分子:这是目前全球最大、可极速搜索的化学空间
- 在普通计算机上,对一个典型的先导化合物(lead)进行搜索的平均耗时仅为 2 到 4 分钟
- 具备出色的骨架跃迁(scaffold hopping)能力,有助于探索 无知识产权(IP-free)区域 的新颖结构
可用性
您可点击此处下载并试用 InfiniSee。
Enamine REAL 化合物空间还可以通过 BioSolveIT 的以下工具进行访问:
● FTrees(模糊药效团搜索)
● SpaceLight(指纹图谱 / Tanimoto 相似性搜索)
● SpaceMACS(子结构匹配)
● Pharos3D(三维药效团描述符;用于苗头化合物扩展和骨架跃迁)
● Hyperspace(二维药效团描述符;用于子结构和相似性搜索)
● PharmaScreen(三维药效团搜索)
更多详情请点击此处。
帮助信息
InfiniSee 的使用非常简单便捷。不过,为了以防万一,我们还是为您提供了一些使用帮助。