结构式是化学家和化学研究人员交流的语言,而 Chemdraw 就是绘制结构式的一种工具。画出一副图文并茂的结构式,也为文章和报告增色不少。每年被投递到化学期刊里面的文章不计其数,而一份好的文章,色彩靓丽的图片必不可少。

今天,小编在阅读文献时发现,环肽的空心部分被填充了颜色,环肽几个环,可以通过不同的颜色查看,一目了然。

小编就很好奇,到底用什么方法,能够给空腔着色呢?带着疑问,小编在 Chemdraw 里不停地摸索,还真摸出了一个道道来,下面来与大家分享。

方法:使用“闭合曲线/贝塞尔曲线工具”手动绘制并填充(最常用和灵活)

1、定位空腔: 仔细观察你的分子结构,确定你想要填充的空腔边界大致位置。

2、选择工具: 在左侧工具栏中找到 Pen tool 里 Closed Curve (闭合曲线)或Bezier Curve (贝塞尔曲线)工具(通常图标像一个波浪形或钢笔路径)。

3、绘制轮廓: 沿着你定义的“空腔”边界,仔细地点击并拖动绘制一个闭合的曲线形状。这个形状应该覆盖你想要填充的区域。

· 尽量让曲线贴合空腔边缘。

· 确保路径是完全闭合的(起点和终点重合)。

· 使用贝塞尔曲线可以创建更平滑的边界。绘制时点击设置锚点,拖动调整曲线弧度。

4、填充颜色:

· 选中你刚刚绘制好的闭合曲线形状。如果没有闭合,可以在顶部菜单栏选择Curves > Closed。图线便会自动闭合。

· 回到顶部菜单栏的 Curves > Refilled

· 在弹出的颜色选择器中选择你想要的填充色(例如浅蓝、浅红、浅黄等常用于表示空腔的颜色)。

以环己烷为例,用笔点击环己烷的六个点,画笔自动连线。若是连线超过了环己烷,可以把绘制的六边形拉出来,稍微压缩一下,或是 Object > Scale进行设置,调整完毕后,再放回原处。

小贴士:由于结构式太小,可以放大屏幕,让环己烷结构式更大。便于用画笔连线

5、调整透明度(关键步骤):

· 保持闭合曲线被选中。

· 转到顶部菜单栏的 Curves > Shaded

· 设置一个合适的透明度,这个目前只能手动,选定彩色图片,右击,选择 Color > Other > 规定自定义颜色,通过调整色调,饱和度,亮度数字即可。

6、调整图层顺序(如果需要):

· 选中填充的形状。

· 右键单击,选择 Send to Back 或 Send Backward(可能需要多次操作)。确保填充的形状位于分子结构(原子、键)的下方,这样分子结构才会显示在填充色之上。如果填充形状正好在环上方且不需要看到环内的键,保持其在前面也可以。

7、调整边框:

· 通常不需要边框线。选中填充形状,在 Object > Object settings > Drawing > Line Width 中选择 None 或最细的线宽。或者选中形状后,右击,Object settings里进行设置。